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邁克·沃特曼(Michael S. Waterman)

美國國籍,計算生物學(xué)家。19426月生于美國。1969年獲美國密西根州立大學(xué)博士學(xué)位。1995年當選為美國藝術(shù)與科學(xué)學(xué)院院士,2001年當選為美國科學(xué)院院士,2012年當選為美國工程院院士。 

邁克·沃特曼是計算生物學(xué)奠基人之一,他致力于將數學(xué)、統計、計算機科學(xué)應用于分子生物學(xué)問(wèn)題中,開(kāi)辟了多個(gè)重要研究方向。他與Smith發(fā)展的Smith-Waterman算法奠定了生物信息學(xué)算法的基礎,他與Lander發(fā)展的生物序列映射數學(xué)模型成為人類(lèi)基因組計劃的重要理論基石,他與Pevzner發(fā)展的歐拉圖組裝方法是新一代測序中所有大規模短序列拼裝算法的基礎,他的工作在數學(xué)界和計算機界也有廣泛和深遠的影響。序列比對是研究核酸和蛋白質(zhì)序列中的最基本任務(wù),在生物學(xué)多個(gè)領(lǐng)域有重要應用。他在早期為這一領(lǐng)域奠定了堅實(shí)、嚴格的理論基礎。序列數據庫搜索的核心是發(fā)現兩個(gè)序列中最相近的片斷,Smith-WatermanS-W)算法實(shí)現了二項式復雜度,之后擴展為尋找k個(gè)無(wú)交疊的比對片斷,成為生物序列比對算法的經(jīng)典和基礎,被絕大多數生物信息數據庫采用。人類(lèi)基因組計劃的一個(gè)關(guān)鍵是對未知基因組進(jìn)行隨機采樣后通過(guò)讀段重疊構造基因組物理圖譜。Lander和沃特曼提出了覆蓋度分析的數學(xué)模型,在人類(lèi)基因組計劃中發(fā)揮了重要的作用,成為該計劃和其他基因組測序的重要理論基礎。現在,這一模型已被擴展到宏基因組等更多領(lǐng)域中。在人類(lèi)基因組計劃中,直到2001年,序列都是通過(guò)重疊-布局-共識方式確定。隨著(zhù)新一代測序技術(shù)發(fā)展,讀段數目大大增加使這種方法無(wú)法實(shí)現。他開(kāi)拓性地提出了基于歐拉圖(也叫De Bruijn圖)的技術(shù),完全重新定義了這個(gè)問(wèn)題,這種圖搜索的技術(shù)路線(xiàn)成為新一代測序中序列拼接組裝的基礎,多數新一代測序組裝軟件都采用了這種方法或其變形。

早在1997年,邁克·沃特曼應邀出席在內蒙古的一個(gè)學(xué)術(shù)會(huì )議并訪(fǎng)問(wèn)北京大學(xué),他那次訪(fǎng)問(wèn)和學(xué)術(shù)報告對中國早期計算生物學(xué)研究產(chǎn)生了很大的影響。2008年起,他受聘為清華大學(xué)講席教授,領(lǐng)導由7位海外杰出學(xué)者組成的教授組在清華開(kāi)展工作。他對我國其他高校和中科院科研所也做了很多貢獻。他與北大錢(qián)敏平教授與陳永川院士領(lǐng)導的南開(kāi)大學(xué)組合數學(xué)中心有密切的學(xué)術(shù)聯(lián)系;他指導過(guò)的多位中國博士后和訪(fǎng)問(wèn)學(xué)者現已成為中科院的學(xué)術(shù)骨干。他對中國國際學(xué)術(shù)交流也作出了巨大貢獻。2009年,他擔任在北京召開(kāi)的APBC2009大會(huì )程序委員會(huì )共同主席并做主題報告,并擔任上海IJCBS國際會(huì )議名譽(yù)主席。在他的建議和幫助下,本領(lǐng)域最有學(xué)術(shù)影響的RECOMB年會(huì )2013年在清華大學(xué)召開(kāi)。